Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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