Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms