Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OTOA-204ENST00000388958 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND2A-208ENST00000492720 3614 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF4-202ENST00000374199 3212 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL022323.2-201ENST00000623239 3000 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NF1P1-201ENST00000604105 2645 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD8-227ENST00000641393 4069 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA2-202ENST00000394709 5400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX3-202ENST00000336840 2038 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL391421.1-201ENST00000372387 1922 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF2D-202ENST00000367114 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00494-201ENST00000416742 3544 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 KCTD20-204ENST00000449081 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A1-202ENST00000399246 3855 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 DRGX-201ENST00000374139 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012377.1-201ENST00000499797 2730 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms