Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms