Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYVE1Q9Y5Y7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYVE1Q9Y5Y7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms