Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPR55Q9Y2T6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GPR55Q9Y2T6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms