Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTLC3Q9NUV7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTLC3Q9NUV7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms