Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB18Q9NP72 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms