Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP29Q9HBJ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP29Q9HBJ7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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