Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AP005121.2-201ENST00000583306 1101 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF39Q9H2S5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF39Q9H2S5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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