Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDGFDQ9GZP0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDGFDQ9GZP0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms