Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCMBPQ9BTE3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MCMBPQ9BTE3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms