Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NICN1Q9BSH3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NICN1Q9BSH3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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