Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3BQ9BS92 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms