Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCT8L2Q96SF2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCT8L2Q96SF2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms