Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLCC1Q96S66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms