Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED4Q96RK1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED4Q96RK1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms