Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms