Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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GTF3C6Q969F1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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