Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DPF3Q92784 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DPF3Q92784 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms