Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF680Q8NEM1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF680Q8NEM1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF680Q8NEM1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF680Q8NEM1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms