Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.853e-6■□□□□ 11.1
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AGGF1Q8N302 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 26.9□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 11.1
AGGF1Q8N302 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.63e-6■□□□□ 11.1
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AGGF1Q8N302 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.045e-14■□□□□ 11
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AGGF1Q8N302 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.155e-14■□□□□ 11
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AGGF1Q8N302 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-18■□□□□ 11
AGGF1Q8N302 RPL5-203ENST00000461952 1116 ntTSL 29.53□□□□□ -0.889e-9■□□□□ 11
AGGF1Q8N302 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 11
AGGF1Q8N302 SLAIN2-203ENST00000506375 349 ntTSL 55.71□□□□□ -1.53e-8■□□□□ 11
AGGF1Q8N302 HIST1H2BN-202ENST00000449538 715 ntTSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.311e-16■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-16■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-16■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 RSL1D1-209ENST00000573618 710 ntTSL 58.68□□□□□ -1.022e-8■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.152e-8■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 36.15□□□□□ -1.422e-8■□□□□ 10.9
AGGF1Q8N302 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 10.9
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