Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMUB2Q71RG4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms