Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q71RC1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q71RC1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q71RC1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q71RC1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q71RC1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms