Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP43Q70EL4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP43Q70EL4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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