Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDZRN4Q6ZMN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms