Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXD4L3Q6VB84 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXD4L3Q6VB84 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms