Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIE3

VWA5B1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B1Q5TIE3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VWA5B1Q5TIE3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms