Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AMER1Q5JTC6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AMER1Q5JTC6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms