Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL40Q2TBA0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms