Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRADDQ15628 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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