Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HERC3Q15034 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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