Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LAPTM4AQ15012 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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LAPTM4AQ15012 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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LAPTM4AQ15012 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAPTM4AQ15012 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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