Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLINT1Q14677 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms