Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CBFBQ13951 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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