Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TOP3AQ13472 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOP3AQ13472 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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