Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MSLNQ13421 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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