Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PRDM2Q13029 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRDM2Q13029 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PRDM2Q13029 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
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