Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNB2Q08289 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms