Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms