Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA6Q01524 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms