Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TFAMQ00059 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms