Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM193AP78312 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms