Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RHOBP62745 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms