Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AQP4P55087 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AQP4P55087 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AQP4P55087 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AQP4P55087 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms