Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms