Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ME1P48163 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ME1P48163 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ME1P48163 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ME1P48163 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ME1P48163 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms