Protein–RNA interactions for Protein: P46531

NOTCH1, Neurogenic locus notch homolog protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH1P46531 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NOTCH1P46531 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTCH1P46531 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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