Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms