Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMOD1P29536 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMOD1P29536 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms